Ifølge Atlas Flora Danica* er bakkegøgeurt registreret i på 3 lokaliteter i 2 ruder alle i Himmerland. Arten blev fundet første gang på den ene lokalitet, Himmerland 1, i 1957, mens den siden er blevet fundet på de to andre henholdsvis Himmerland 2 i 1997 og Himmerland 3 i 2007.
Bakkegøgeurt vokser på afgræsset kalkgræsland, kalkoverdrev, kalkskrænt, overdrev og tøreng.
Bakkegøgeurt har i 30 års perioden været overvåget på de 3 himmerlandske lokaliteter. Himmerland bestand 1 indgik i programmet ved starten i 1987 og blev overvåget næsten kontinuert frem til 2003, hvor de årlige optællinger ophørte. I 2008 blev 67 blomstrende planter registreret. De to andre indgik i programmet i det år, hvor de blev fundet. Himmerland bestand 2 blev overvåget kontinuert frem til 2003, hvor overvågningen blev indstillet, mens Himmerland bestand 3 fortsat overvåges uregelmæssigt. Da både vegetative og blomstrende planter er blevet optalt på de tre lokaliteter, er alle optalte skud indgået i analysen og præsenteres samlet i det følgende.
Både det samlede og det gennemsnitlige antal skud kulminerede i 1998-1999 og 2002-2003 med henholdsvis 194/53 og 219/37 samt 281/55 og 248/59 blomstrende og vegetative planter (Fig. 1 og 2). Den store mængde af især blomstrende planter hidrører fra Himmerland bestand 2. Himmerland bestand 3 er den mindste, idet der maksimalt er optalt 3 blomstrende planter i 2007 og 4 planter i 2010.
Det samlede antal planter er faldet betragteligt efter at overvågningen af de to store bestande, Himmerland 1 og 2, er blevet indstillet dog med undtagelse af 2008, hvor der er blevet foretaget en optælling af blomstrende planter i Himmerland 1. Arten er på den baggrund ved rødlistevurderingen 2020 kategoriseret i kritisk truet (CR).