Ifølge Atlas Flora Danica* er kødfarvet gøgeurt registreret i 338 ruder fordelt over det meste af Danmark. Arten er ikke blevet registreret i den centrale del af Midt- og Sydjylland, på Als og Vestlolland. Den er siden status i 1948 gået tilbage i den sydøstlige del af Jylland, på Fyn og Sydvestsjælland, mens den er blevet mere almindelig langs Den jyske Vestkyst, det nordvestlige Jylland og i Vendsyssel.
Kødfarvet gøgeurt vokser på steder med lysåbent, lavtvoksende vegetationsdække gerne på fugtig, kalkholdig og ikke for næringsfattig jordbund. På mange voksesteder er dens forekomst afhængig af drift i form af afgræsning eller høslæt uden tilførsel af kunstgødning.
Syv bestande af kødfarvet gøgeurt indgik i overvågningen ved programmets start i 1987. Antallet af overvågede bestande blev forøget i de følgende år og toppede i perioden 1993-2001, hvor over 20 bestande blev overvåget årligt. Ingen bestande har været overvåget kontinuert i alle 30 år. 44 lokaliteter, hvor der foretaget optællinger i tre år eller mere, er indgået i nærværende analyse.
Bestanden i Gøderup Mose på Midtsjælland er blevet overvåget kontinuert i 20 år begyndende i 1987 og afsluttet i 2006, mens bestandene i Gerlev Mose i Hornsherred og Krogenlund Mose i Nordsjælland har været overvåget med afbrydelser i 24 og 21 år i perioderne 1987-2014 og 1990-2016. Det højeste antal på 5.023 blomstrende planter blev optalt på Gyldenstrand ved Frederikssund i 2013.
Kødfarvet gøgeurt er den primære orkidé for de årlige optællinger på nogle lokaliteter, mens det på mange lokaliteter er andre orkidéer, der er det primære mål for overvågningen. Således er salep-gøgeurt den primære orkidé på flere sjællandske lokaliteter, mens kødfarvet gøgeurt i overvågningssammenhæng er sekundær. På andre lokaliteter vokser kødfarvet gøgeurt sammen med andre orkidéer f.eks. maj- og plettet gøgeurt, som ofte også er blevet optalt.
Det største samlede antal af kødfarvet gøgeurt blev registreret i 2013, hvor 9.912 blomstrende planter blev optalt på 16 lokaliteter, mens det laveste samlede antal på 408 blev optalt i 2007 på 7 lokaliteter (Fig. 1). Fra 1987 til 2008 har det gennemsnitlige antal stort set svinget omkring 100 blomstrende planter med 2006 som en undtagelse, hvor det gennemsnitlige antal er 282. Fra 2009 og frem til 2015 forøges det gennemsnitlige antal markant og overstiger i de fleste år 400 blomstrende planter. I 2016 halveres antallet (Fig. 2). Årsagen til den markante stigning er, at der fra 2009 er indgået flere individrige, sjællandske bestande i overvågningsprogrammet.
De 30 års overvågning af kødfarvet gøgeurt viser en relativ stabil udvikling i det gennemsnitlige antal af blomstrende planter fra 1987 frem til og med 2008. I 2009 stiger det gennemsnitlige antal af blomstrende planter markant, hvilket skyldes, at flere individrige bestande, der totaloptælles, indgår i overvågningsprogrammet, og ikke, at den er i fremgang. Kødfarvet gøgeurt er ved rødlistevurderingen 2020 kategoriseret i livskraftig (LC).
