Formålet med Center for Green Transition and Marine Ecology er at:

• Følge udviklingen af to energiøer i Nordsøen.
• Undersøge hvordan havvindmølleparkers fysiske ændringer af havbundens levesteder påvirker biodiversiteten, og hvordan en sådan succession forløber i årene, efter at en møllepark er sat i drift.
• Forstå hvilke konsekvenser tilstedeværelse af havvindmøller kan have for fuglebestande i de danske farvande.
• Måle effekten af nye offshore mølleparker på havpattedyr, herunder i hvilket omfang mølleparkerne påvirker fødetilgængeligheden og mængden af undervandsstøj, samt i hvilket omfang de berørte områder er vigtige for havpattedyrene.
• Indhente større viden om flagermustræk og fourageringsadfærd over de danske farvande, så påvirkning på dødelighed og forringet bevaringsstatus for flagermusbestande ved etablering af havvindmølleparker kan kalkuleres.
• Kortlægge udvalgte nøgle- og beskyttede fiskearters fordeling i dansk farvand samt deres gyde-, opvækst- og fourageringsområder og vigtige migrationsruter.
• Forbedre vores forståelse for konsekvenserne ved ændringer i hydrodynamikken ved stor-skala udbygning af havvind i danske farvande.
• Opnå en dybdegående kortlægning og miljørisikovurdering af potentielle afledte miljøeffekter fra CO₂ neutrale brændstoffer.